甘肃中医药大学开设的专业有：运动康复、藏药学、卫生检验与检疫、护理学、临床医学、康复治疗学、中西医临床医学、中医学、软件工程、药品经营与管理、药学等。甘肃中医药大学专业设置一览表：
| 学院 | 专业 | 体育健康学院 | 运动康复 |
|---|---|
| 藏医学院 | 藏药学藏医学 |
| 公共卫生学院 | 卫生检验与检疫预防医学 |
| 护理学院 | 护理学助产学护理 |
| 临床医学院 | 临床医学医学影像学医学检验技术医学检验技术医学影像技术 |
| 针灸推拿学院 | 康复治疗学针灸推拿针灸推拿学 |
| 中西医结合学院 | 中西医临床医学 |
| 中医临床学院 | 中医学中医骨伤科学中医骨伤中医学 |
| 信息工程学院 | 软件工程医学信息工程 |
| 经贸与管理学院 | 药品经营与管理国际经济与贸易应用心理学健康服务与管理 |
| 药学院 | 药学药品质量与安全中草药栽培与鉴定药品生产技术中药制药中药学 |
学校前身是1978年创立的甘肃中医学院；1989年，学校在甘南州卫生学校藏医学专业基础上创办藏医系，逐渐发展为具有硕士学位授予资格的藏医学院；2、014年，定西师范高等专科学校整体并入；
2015年，学校正式更名为甘肃中医药大学；
2017年,和平校区一期项目完工并投入使用，逐渐完成教学及行政整体迁入；
2018年，顺利通过教育部本科教学工作审核评估，并与上海中医药大学签订了合作协议。
经过四十载薪火相传和砥砺奋进，学校已实现“办学层次提升”和“办学空间拓展”两大目标。
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