重庆医科大学开设的专业有：临床医学（定向培养）、口腔医学、临床医学(“5+3”一体化)（培养方向：儿科学）、临床医学、听力与言语康复学、英语、医学信息工程、中医学、生物医学工程(医疗器械方向)、临床药学、应用统计学、医学检验技术、生物信息学、护理等。重庆医科大学专业设置一览表：
| 学院 | 专业 | 第五临床学院 | 临床医学（定向培养） |
|---|---|
| 口腔医学院 | 口腔医学口腔医学技术 |
| 儿科学院 | 临床医学(“5+3”一体化)（培养方向：儿科学）儿科学 |
| 第二临床学院 | 临床医学医学影像学康复治疗学临床医学(“5+3”一体化) |
| 第一临床学院 | 听力与言语康复学精神医学临床医学(“5+3”一体化)临床医学麻醉学医学影像技术 |
| 外国语学院 | 英语 |
| 医学信息学院 | 医学信息工程智能医学工程信息管理与信息系统 |
| 中医药学院 | 中医学中医康复治疗学中西医结合中医骨伤科学中药制药中药学针灸推拿学 |
| 生物医学工程学院 | 生物医学工程(医疗器械方向) |
| 药学院 | 临床药学药学药物制剂 |
| 公共卫生与管理学院 | 应用统计学预防医学卫生检验与检疫公共事业管理食品卫生与营养学 |
| 检验医学院 | 医学检验技术生物技术 |
| 基础医学院 | 生物信息学医学实验技术法医学基础医学 |
| 护理学院 | 护理护理学 |
2015年成为重庆市人民政府、国家卫生健康委员会（原国家卫生计生委）和教育部共建高校，2016年成为“高等学校学科创新引智计划”（“111计划”）首批立项的地方高校之一。
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