东京大学成立于1877年。现有10个学院，14个研究生院，学生总数27000人，教师约4000人。学生中研究生占12000人，其中包括博士生5600人。位于东京市内的主校区只有清华面积的十分之一，新校区只能设在千叶县。
多年来东京大学一直把自己的社会责任定位在提供杰出人才方面，即为明天的领袖提供最好的教育。东京大学也确实为日本政府、财界和学术界培养了众多的领导人。最近几年学校认识到要提高国际学术声望，还必须产生世界一流的科研成就，要积极地将研究成果返回给社会和工业界。为此学校的对策是从发展前沿交叉学科入手。新建的前沿科学研究生院的目的在于促进学科融合。跨学科的信息科学研究生院是人文与科技的结合。
东京大学本科生院系包括法、医、工、文、理、农、经济、教育、和药学。研究生院包括法律政治、医学、工程、人文社会学、理科、农学、生命科学、经济、艺术与科学、教育、药学、数学科学、前沿科学、和两个与信息技术有关的交叉学科。
作为世纪之交的教改措施，学校大力加强研究生院的建设，改革教学科研体制，改进本科后2年的教学，提高研究生教学科研水平。
东京大学重视国际合作与交流，1994年起东京大学与MIT，苏黎世高工合作开展全球可持续发展交叉学科研究计划。在MIT、硅谷、和斯坦福大定期举办东大海外论坛。东大有国外访问学者1600人，留学生超过2100名，其中90%为研究生。
东京大学的校长由全体教师投票选出，任期4年，不连任。上一届校长为Shigehiko Hasami（莲实重彦），2001年8月Takeshi Sasaki（佐佐木毅）接任为第27任校长。院系为自治体，教师大会是最高权力机构。2000年学校经费约为17亿美元，90%为政府拨款。
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