罚款净收入和罚款支出的区别在于：
1、两者之间的定义存在区别：罚款净收入指企业因滞纳金及各种形式所取得的罚款收入，而罚款支出指企业因罚款或滞纳金等形式向相关机构所缴纳的支出。
2、两者所适用的会计科目存在区别：罚款净收入一般通过“营业外收入”科目进行处理，而罚款支出一般通过“营业外支出”科目进行处理。
其中罚款净收入和罚款支出同属于企业在日常生产经营活动所发生的与其生产经营无直接关系的特殊性利得和损失。
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