公共管理硕士与工商管理硕士的主要区别在于培养目标不同和申请学位目的不同。其工商管理硕士主要培养私人部门的管理人才，公共管理硕士主要是培养公共部门的管理人才；工商管理硕士学位申请主要是满足企业的管理需要培养人才，公共管理硕士则主要是满足政府部门及公共机构需要的管理人才，详细分解如下：
培养目标不同
工商管理硕士是为适应社会公共管理现代化、科学化和专业化的要求而设立的，其培养目标是为相关企业及部门培养德才兼备、适应社会主义现代化建设需要的高层次、应用型、复合型的管理人才。
公共管理硕士培养目标是为政府部门和非政府公共机构培养具有现代公共管理理论和公共政策素养、掌握先进分析方法及技术、精通某一具体政策领域的专业化管理者和政策分析者。
申请学位目的不同
工商管理硕士学位是一种注重复合型、综合型人才培养的学位，是能力培养重于知识传授的学位，学位申请主要是满足企业的管理需要培养人才；公共管理硕士教育是一种通才教育，则主要是满足政府部门及公共机构需要的管理人才。
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