中药学是许多个体药类的总称，方剂学是辩证科学的应用，把多个中药的功效集中在一块使它发出最好的药力。中药学是中药师的基础，方剂学是中医师的基础。
中药学研究的是中药基本理论，和中药的性味，归经，功效，临床运用等知识的一门学科。
而方剂学研究的是方剂组方原理，配伍规律和临证运用的学科。
两者最重要的区别在于中药研究的是单味药物的功效，而方剂研究的是多味药物组方之后的功效，不是简单的药物相加，其中还蕴含着很多的中医药物的基本理论
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