乳酸菌是细菌，属于原核生物，原核生物由原核细胞构成。原核细胞没有由核膜包围的细胞核，只有相当于真核细胞细胞核功能的拟核。
原核细胞细胞质中也没有高尔基体、线粒体、内质网核叶绿体等复杂的细胞器。 酵母菌、青霉菌、蘑菇是真菌，属于真核生物，由真核细胞构成。 所以乳酸菌与酵母菌、青霉菌、蘑菇有明显的区别。
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