哈尔滨工程大学和哈尔滨工业大学的核专业在各自领域都有一定的优势和特色，但具体哪个更强，需要根据不同的评估标准和个人需求来判断。
哈尔滨工程大学在核工程与核技术领域有着较高的声誉和影响力。其核科学与技术学院汇聚了一批知名的核动力专家和优秀的年轻学者，形成了一支结构合理、奋发向上、团结协作的高水平国际化的师资队伍。此外，哈尔滨工程大学在核电站虚拟现实教学方面也有显著的成果，为核工程与核技术专业的学生提供了先进的实验教学条件。
哈尔滨工业大学在核化工与核燃料工程专业方面表现突出，高居校友会2023中国大学相关排名的前列。此外，哈尔滨工业大学在国防科技方面有着深厚的积淀和实力，拥有一系列与核能相关的科研成果和技术实力。例如，学校拥有一辆真实的东风26导弹发射车，并具备核打击能力，这显示了其在核能领域的不俗实力。
综上所述，哈尔滨工程大学和哈尔滨工业大学的核专业各有优势，无法简单地判断哪个更强。选择哪个学校的核专业，需要根据个人的兴趣、职业规划、学术追求以及学校的专业特色、师资力量、科研实力等多方面因素进行综合考虑。
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