西南医科大学，位于四川省泸州市。省属重点大学。前身为1951年建的西南区川南医士学校；1959年升级为泸州医学专科学校；1978年升格为泸州医学院；2015年12月升级为西南医科大学。遵义医学院，位于贵州省遵义市。省属重点大学。创建于1947年，原大连医学院1965年整体搬迁遵义后，于1968更名为遵义医学院。两所学校从级别上来看，西南医科大学比遵义医学院要强一些，毕竟一所是“医学院”，一所是“医科大学”嘛。但是遵义医学院目前也要进入“医科大”行列了。从牌子上来说，没啥区别，都是双非高校。根据教育部近期学科评估结果来看，西南医科大学有1个学科上榜，临床医学评级为C-；遵义医学院有2个学科上榜，分别是临床医学C-级，药学C级。遵义医学院要比西南医科大学多一科。综上所述，遵义医学院还是比西南医科大学好一点。
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