有硕士点。
济宁医学院有临床医学一级学科的硕士专业学位授予点，招生专业包括内科学，外科学，儿科学，急诊医学，肿瘤学，临床病理，耳鼻咽喉科学，临床检验诊断学等。
但需要注意的是，报考济宁医学院硕士研究生的考生必须为普通全日制临床医学专业本科毕业生，报考专业应与所学专业相同，专业学位各专业不接收跨专业报考。
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