是的，存在中国医学科学院健康科普研究中心这样的机构。该机构现为中国医学科学院下属的非法人单位，自2009年起由中国协和医科大学出版社负责运营。
不过，对于你所描述的培训中医全科健康理疗师并缴费的情况，需要谨慎对待。可能有些人利用这个机构的名义进行招生并开展相关的培训课程。在选择参加此类培训课程时，需要确认该机构是否合法并查证其资质，以避免上当受骗。
以上信息仅供参考，如有更多疑问，可以查阅中国医学科学院健康科普研究中心官方网站或咨询专业教育机构，以获取更准确全面的信息。
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