公司支付给自然人购房违约金，这个针对个人来说属于个人的偶然所得，是需要缴纳20%的偶然所得个人所得税，需要由支付单位在支付的时候代扣代缴相关税款。
公司支付给自然人购房违约金账务处理是，
借：营业外支出，
贷：银行存款等科目，
应交税费—个人所得税。
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