新西伯利亚州水力资源十分丰富。这里约有430条河流，最大的河流鄂毕河是世界著名大河之一。鄂毕河发源于阿尔泰冰川，注入北冰洋，航运价值很大。1956年人们在离新西伯利亚巾不远的鄂毕河上修建了大坝和水电站。此外，还有伊纽河，很多新西伯利亚人的别墅就分布在它的两岸；美丽如画的别尔季河：水流比较平缓的塔拉河、鄂木河、卡尔加河、卡拉苏克河。新西伯利亚州也称“湖州”，这里有大小湖泊几千个，主要分布在巴拉宾低地。该州的地下水资源有很大的利用价值，其所含矿物质可用来治病，地热则可用来取暖。西南部的咸水湖中含有盐和苏打及用来治病的淤泥。全国有名的疗养院就位于卡拉奇咸水湖区。农业用地占新西伯利亚州总面积的47.7%(其中耕地22.2%)，森林面积占26.6%，灌木丛面积占1.6%，沼泽地面积占17.4%，水域面积占4.3%，其他土地资源占2.5%。农业用地在全州分布较为均匀，该州改良土地面积约为11.3万公顷，其中的10.66万公顷属农业耕地。农业灌溉用地约为5.69万公顷，干涸土地面积为5.07万公顷，被破坏土地面积约为2600公顷。 新西伯利亚州约有1200多种野生植物。这里最常见的树种是白桦、花楸、松树、山杨。此外，还有冷杉、云杉、山楂等。中欧森林中常见的树木如橡树、榆树、椴树、白蜡树在本州虽可见到，但都是人工栽种的。
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