两者的区别在于：划分的组织单位不同，分数的计算基数不同，所以分数不同。
大学录取分数线是国家在统筹的录取比例上面，根据所有学生的成绩和想招录的人算出来的最低分数线，只有在最低分数线上面才有可能被录取。
专业分数线是高校根据报考该专业的人的多少和考试分数高低排列，截取部分人的分数所产生的分数线，一般专业分数线会在大学最低录取分数线之上，越是火爆的高校或者专业，专业录取线就比较高。
专业录取规则：
1.分数清：分数清是指根据学生成绩的高低安排顺序，分数优先、遵循志愿，能极大保证高分数段考生进入自己想学习的专业。
2.志愿清：志愿清是根据学生的专业志愿顺序进行专业的录取，志愿优先原则，优先保障第一志愿的考生。
3.分数级差：分数级差是在分数清的基础上进行的，如果该考生第一专业志愿因为名额所限没有被录取，那需要减去一定的分数进入第二专业志愿的录取，相对来说最复杂。
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