南华大学有九个国家重点学科。
分别是：核科学与技术、土木工程、内科学、公共卫生与预防医学、矿业工程、机械工程、管理科学工程、药学、基础医学、这几个重点学科。工程硕士专业学位授权领域：机械工程、电子与通信工程、控制工程、计算机技术、建筑与土木工程、化学工程、矿业工程、安全工程、核能与核技术工程、环境工程、制药工程截至2018年9月，南华大学拥有博士后科研流动工作站3个、学术学位一级学科博士点5个、学术学位二级学科博士点33个、学术学位一级学科硕士点24个、学术学位二级学科硕士点127个。硕士专业学位授权类别13种、工程硕士专业学位授权领域11个；拥有国家国防支撑学科1个、国家国防特色学科5个、湖南省重点学科9个、湖南省优势特色学科1个。学校临床医学学科进入ESI全球排名前1%。学术学位一级学科博士点：矿业工程、核科学与技术、安全科学与工程、基础医学、临床医学硕士专业学位授权类别：临床医学、工程、工商管理、会计、金融、公共卫生、护理、法律、艺术、应用统计、翻译、药学、公共管理
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