按照您所描述的，是会被退档的。
当一所大学在一本批次投放了专业，也在二本批次投放了专业，其在一本批次投放的专业只能填在一本批次的院校志愿组别里面，而所投放的二本批次专业只能填在二本批次的院校志愿组别里面的。所以把二本批次的专业填到了一本批次的院校组别内，属于无效志愿，因为一本录取时，仅仅是看所投放的一本批次的专业，是不进行所投放的二本批次专业的。所投放的二本批次专业是在二本批次投档时才有效的。比如一所高校A，投放了专业10,12,14,15在一本批次；然后投放了20,25,30在二本批次；那么一本批次志愿只能填这所高校的10,12,14,15中的专业，而在二本批次志愿只能填这所高校的20,25，30中的专业，不能跨批次，否者就是无效志愿了。
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