特殊的普通发票如收购农产品普通发票，运费普通发票等是可以抵扣，其他的普通发票不得抵扣，只有专用发票才能抵扣。
企业向农业生产者个人收购农产品，可以自行开具农产品收购发票，并按照收购发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算抵扣进项税额。小规模纳税人销售农产品依照3%征收率按简易办法计算缴纳增值税而自行开具或委托税务机关代开的普通发票。
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