一、性质不同
1、体外：进行或发生于试管内的实验与实验技术，在活生物体之外的环境中的操作。
2、体内：用药物对动物进行干预后,再取相应组织进行指标检测。
二、特点不同
1、体外：体外实验可以实现小型化和自动化，产生用于在药理学或毒理学中测试分子的高通量筛选方法；可以在没有来自实验动物的细胞反应的“外推”的情况下研究人细胞。
2、体内：体内实验不可避免物种差异引入额外的不确定因素,但将这些数据转化为临床应用才是目标。
三、方式不同
1、体外：不一定是细胞，关键是动物体外，不经过体内。例如细胞、微粒体、S9、半渗透膜、试管里各种反应，等等。关键动物体外的实验。
2、体内：经过某种途径进入活体动物，然后经过各种方式检测某种组织、器官等，例如血液等等，或者动物行为等。
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