课程顶替是指部分自学考试专业因关停并转，将停考课程或调整课程根据调整后的专业考试计划规定，替代为指定的其他课程。
自考顶替课程就是自考免考课程，分为两种情况：
1.同等学力的免考思想政治课，部分公共课要看在本科院校里的成绩单去核算学分；
2.曾经考过自考，自考里的课程代码，课程名称，学分三者一致即可不用考。
在自考本科过程中，考生取得国家承认学历的各类高等学校及自学考试专科以上(含专科)的毕业生及肄业生、退学生，可免考有效期课程名称相同、学分等于或低于原所学课程的课程。
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