上海工程技术大学拥有11个一级学科硕士学位授权点。
一级学科硕士学位授权点：机械工程、材料科学与工程、纺织科学与工程、化学工程与技术、控制科学与工程、交通运输与工程、工商管理、公共管理、设计学、马克思主义理论、统计学
硕士专业学位授权点：电子信息硕士、交通运输硕士、艺术硕士（艺术设计）
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